Audpcの計算方法

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著者: Laura McKinney
作成日: 3 4月 2021
更新日: 1 11月 2024
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AUCの計算方法
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疾患進行曲線下面積(AUDPC)は、経時的な疾患強度の定量的尺度です。植物の病理学で使用され、さまざまな植物の病気に対する抵抗性のレベルを示し、比較します。台形法は、AUDPCを計算する最も一般的な方法です。これは、1990年にキャンベルとマッデンが考案した公式を使用するか、時間に対する感染の割合のグラフをプロットし、時間間隔ごとに台形を合計することによって実行されます。

病気の進行を測定する

    調査する特定の病気と作物の測定に適用される研究ルールとガイドライン。植物サンプルの必要なサイズは、作物と病気によって異なります。たとえば、塊茎の疫病の研究には、最低40の植物のサンプルが必要です。

    研究に必要な適切な数の植物を植えます。

    病気の兆候に注意してください。兆候がいつ発生すると予想されるかを調査し、準備を整えます。たとえば、疫病の兆候は、植え付けの約30〜40日後および殺菌剤の最後の適用の10日後に発生します。

    病気に気付いたらすぐに、サンプル中の感染した葉の面積の割合を視覚的に推定します。

    感染した葉の面積の割合を定期的に記録します。病気が予想よりも速く進行する場合、研究者は疫病の読書を7日ごとに行います。病気の進行が遅い14日ごとに測定値が取得されます。

    感染の割合の増加が止まったら、感染測定値の記録を停止し、病気の進行レベルを記録します。

方程式からAUDPCを計算する

    記録した最初の2つの感染率を追加します。

    加算結果を2で除算して、2つの読み取り値の平均値または中間値を見つけます。

    平均値または中間値に時間間隔を掛けます。時間間隔は、最初の読み取りから2番目の読み取りまでの日数です。たとえば、20日目に最初の測定値を取得し、27日目に2回目の測定値を取得した場合、日数または時間間隔は7日間です。

    結果をパーセント日単位で記録します。値は台形の面積です。

    2回目と3回目の感染測定値について、手順1〜4を繰り返します。その結果、2番目の台形の領域になります。すべての測定値の台形面積を計算するまで、手順1〜4を繰り返します。

    すべての台形を追加して、AUDPCを見つけます。 AUDPCが低いほど、病気の進行が遅くなり、病気に対する抵抗力が大きくなります。 AUDPCが高いほど、疾患の進行が速くなり、疾患に対する感受性が高くなります。

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