干渉を計算する方法

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著者: Monica Porter
作成日: 20 行進 2021
更新日: 27 10月 2024
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6 2 GNSS干渉測位の原理
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遺伝的交叉とも呼ばれる染色体交叉は、遺伝子が再結合する通常のプロセスです。組み換えは、異なる形質を生み出すために組み換えることにより遺伝的変異を増加させます。

TL; DR(長すぎる;読まなかった)

遺伝子干渉は、相互のクロスオーバーの独立性の尺度です。ある地域のクロスオーバーが別の地域のクロスオーバーに影響する場合、その相互作用は干渉と呼ばれます。干渉= 1-c.o.c.、ここでc.o.c.一致係数(c.o.c.)

人間には23の染色体があります。減数分裂の間、1つの細胞は2回分裂して4つの娘細胞を形成します。これらの4つの娘細胞は、親細胞の染色体数が半分です。その後、卵または精子の別の半分の染色体に結合して、完全なペアになります。

時には、これらの2つの部分が一緒にとどまらないことがあります。破片が壊れた場合、別の破片と結合できます。再結合する2つの遺伝子コピーは染色分体と呼ばれます。ダウン症候群やその他の遺伝的障害などの問題は、遺伝子の組み合わせが正しくない場合に発生する可能性があります。

ほとんどのクロスオーバーは正常に発生します。時折、二重クロスオーバーが発生します。これは、染色分体が1つではなく2つの点で結合する場合です。 2番目の接触点では、染色分体が再び分離され、遺伝情報が再び交換されます。

遺伝子干渉は、相互のクロスオーバーの独立性の尺度です。つまり、二重交差が起こることがわかっているので、隣接する染色体領域の交差が独立しているかどうかの質問に答えなければなりません。それらが独立していない場合、ある地域でのクロスオーバーは、隣接する地域でのクロスオーバーの可能性に影響します。ある地域のクロスオーバーが別の地域のクロスオーバーに影響する場合、その相互作用は干渉と呼ばれます。

干渉を計算する方法

干渉の計算方法を検討する場合、最初のステップは一致係数(c.o.c.)の計算です。 c.o.c.同様に、「二重組換えの頻度」としても知られる、交差頻度値と呼ばれる二重交差の可能性に依存します。

コインシデンス係数は、観察された二重組換え体に対する観察された組換え体の比率です。

一致係数=観察された二重組換えの頻度/予想される二重組換えの頻度

2つの独立した領域のサンプルに含まれる二重組換えの予想数は、隣接領域の組換え頻度の積に等しくなります。

干渉は次のように定義されます。

干渉= 1-c.o.c.

干渉は、DNA領域の1つでのクロスオーバーが他の領域でのクロスオーバーの形成をどれだけ強く妨げるかを示します。

干渉がゼロの場合、これは、予測どおりに二重交差が発生していること、および1つの領域での交差が隣接領域での交差とは無関係に発生していることを意味します。

干渉が1の場合、これは干渉が完全であり、1つの領域でのクロスオーバーにより隣接領域でのクロスオーバーの可能性が排除されるため、二重クロスオーバーが観測されないことを意味します。

通常、データには0〜1の干渉が表示されます。ゼロより大きく1より小さい値は、干渉が発生していることを示します。