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1800年代、Gregor Mendelは、遺伝子がどのように機能して子孫に物理的特性を引き継ぐかを予測し、継承される特定の特性の確率を計算しました。科学者たちは後ほど遺伝子の存在さえ発見しませんでしたが、メンデルスの基本原則は正しいことが証明されました。 Reginald Punnettは、メンデルスの原理に基づいて遺伝の確率を計算するためのグラフィカルな方法として、Punnett squareを開発しました。 Punnett正方形で計算するための統計と確率を理解する必要はありません。正方形を作成し、結果を観察して、特定の特性を継承する子孫の確率を判断するだけです。
正方形を描き、1本の水平線と1本の垂直線で4つの小さな正方形に分割します。
支配的な対立遺伝子には大文字を、劣性対立遺伝子には小文字を使用して、正方形の上に1つの親の遺伝子型を記述します。左のボックスの上に一方の対立遺伝子を書き、右のボックスの上にもう一方の対立遺伝子を書きます。茶色の目が優勢であり、青い目が劣性である目の色のプネット正方形の例を考えてみましょう。親が1つの優性対立遺伝子と1つの劣性対立遺伝子を持つ遺伝子型を持っている場合、優性対立遺伝子の1つのボックスの上に「B」、劣性対立遺伝子のもう1つのボックスの上に「b」を書きます。
正方形の左側にもう一方の親の遺伝子型を書きます。 1つの対立遺伝子を上のボックスの左側に、もう1つの対立遺伝子を下のボックスの左側に置きます。たとえば、遺伝子型に2つの劣性対立遺伝子がある場合、各ボックスの横に「b」と記入します。
各ボックスに、その左上に記述された対立遺伝子を入力します。たとえば、左上のボックスの上部に「B」、左側に「b」がある場合、ボックスに「Bb」と入力します。右上のボックスの上部に「b」、左側に「b」がある場合は、ボックスに「bb」と入力します。下の2つのボックスについても同じことを行います。
少なくとも1つの優性対立遺伝子を含むボックスの数を数えます。遺伝子型がBbの親と遺伝子型がbbの親の場合、ボックスにはBb、bb、Bb、bbが含まれます。この場合の2つのボックスには、優性対立遺伝子があります。
優勢な対立遺伝子を持つボックスの数を4で割り、結果に100を掛けて、子孫が優勢な特性を持つ確率を取得します。たとえば、（2/4）* 100 = 50なので、子孫が茶色の目を持つ可能性は50％です。
支配的な特性のパーセントチャンスを100から引き、子孫が劣性の特性を表示するパーセントチャンスを取得します。たとえば、100-50 = 50の場合、子孫が青い目を持つ可能性は50％です。