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19世紀には、分類学-生物の分類-が生物学の大流行でした。アマチュアとプロの博物学者の両方が生き物を収集して特定するという流行に巻き込まれ、まれなカブトムシは熱い商品でした。当時、微生物とその生物界における位置についてはほとんど知られておらず、微生物学の分類はそれほど注目されていませんでした。数十年の間に微生物の知識と微生物の識別方法が劇的に増加し、その増加の一部は微生物の効率的な分類によって実証されました。
分類のコンポーネント
分類法には、命名法、分類、識別の3つの要素があります。命名法は、単に種に名前を割り当てることです。分類とは、共有された特性に従って種をグループ化することです。その一部は物理的であり、一部は生化学的です。識別では、生物の特徴を使用して、分類体系のどこに属するかを判断します。現代の分類体系には、最大かつ最も包括的なグループであるドメインがあります。最小のグループは種です。最も包括的なものから最も具体的なものまで、レベルは次のように実行されます。ドメイン、王国、門、クラス、順序、家族、属、種。あなたは、たとえば、ユーカリヤ動物界脊索動物哺乳類霊長類のヒト科ヒトホモサピエンスです。
微生物とドメイン
微生物は非常に多様です。それらは、特定の種類の構造や機能ではなく、単にサイズによって定義されます。微生物は非常に多様であるため、3つの異なるすべてのトップレベル分類（3つすべてのドメイン）に分類されます。 1つのドメインは細菌であり、もう1つのドメインは古細菌であり、最後のドメインはユーカリヤです。細菌および古細菌ドメインのメンバーはすべて、単細胞微生物です。それらは両方の細胞であり、それらの遺伝物質を細胞の残りの部分から分離する膜のない、核を定義する膜です。したがって、細菌および古細菌ドメイン内のすべての王国、門、階級、秩序、家族、属および種は微生物です。
単細胞原生生物
ユーカリヤは、細胞に核が含まれる生物です。多くの真核生物は単細胞の微生物ですが、レッドウッドの木やあなたのような他の多くの微生物はそうではありません。したがって、追加の分類が必要です。ドメインEukarya内の王国Protistaは、単細胞微生物のみで構成されています。原生生物は、3つの異なる門のグループに分かれています。4つの異なる藻類の門、4つの異なる原生動物の門、2つの異なるカビの門です。しかし、これらの門内のすべての生物は-プロティスタの王国内はすべて微生物です。
微細菌類
菌類の王国は、ユーカリヤのドメインに含まれています。菌類内の一部の門には微生物が含まれています。たとえば、接合菌門には微視的なパンのカビが含まれ、子嚢菌門には酵母、微生物作物の害虫および寄生虫が含まれます。地衣類は真菌と光合成生物の共生集合体であり、一部は真菌界に、一部は他の王国、または他のドメインにさえ含まれています。