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HPLC（高速液体クロマトグラフィー）とGC（ガスクロマトグラフィー）はどちらも、科学者がサンプルを分析してサンプルに含まれるものまたはサンプル中の分子濃度を決定するために使用する方法です。どちらも同じ原理を使用しており、重い分子は軽い分子よりもゆっくりと溶出または流動します（溶出時間にも極性が影響します）。考え方は同じですが、GCとHPLCにはいくつかの違いがあります。
移動相
クロマトグラフィー装置の移動相は、機械を通してサンプルを移動させる物質です。 HPLCでは、移動相は、サンプルとの適合性を確保するために、有機溶媒、超純水、およびその他の成分で構成される液体です。 GCは、移動相にガスを使用します。使用されるガスには、分析対象に応じて、ヘリウム、窒素、アルゴン、または水素が含まれます。
コラム
サンプルがクロマトグラフィーカラムを通過すると、サンプルと移動相がカラムの内容物と相互作用し、サンプルの成分が異なる時間に溶出します。 HPLCカラムは、通常、シリカまたは異なる炭素鎖長で密に詰められた4〜6インチ長の金属またはガラス管です。 GCシステムには、ラボのニーズに応じてさまざまな材料でコーティングされた内壁を備えたコイル状キャピラリーカラムがあります。伸びたGCカラムは100フィートの長さに達することがあります。
サンプル
GCは揮発性化合物（急速に分解する化合物）に使用され、HPLCは揮発性の低いサンプルに適しています。サンプルに塩が含まれているか、電荷が含まれている場合は、GCではなくHPLCを使用して分析する必要があります。
温度管理
GCカラムは、マシン内のオーブンに収容されています。サンプルの分析中にコンピューターが温度を変更します。温度が高いほど、サンプルの溶出は速くなりますが、温度が高すぎると結果が悪くなります。 HPLCカラムは常に安定した温度（ほとんどの場合室温）に保たれます。