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ウエスタンブロットは、特定のサンプル中の特定のタンパク質を特定するために使用される分析技術であり、酵素または蛍光標識一次抗体がその特定の抗原に結合する能力を利用しています。これは、ゲル電気泳動から始まり、その後にメンブレンブロッティングと抗体によるプロービングが続く3段階のプロセスです。タンパク質の検出は直接的または間接的であり、後者は一次に対して標識された二次抗体を使用します。通常のタンパク質分析技術として受け入れられていますが、ウェスタンブロットには利点と同様に制限があります。
利点：感度
ウェスタンブロットを支持する最大の議論の1つは、その感度です。サンプル中のわずか0.1ナノグラムのタンパク質を検出できるため、この手法は理論的には効果的な早期診断ツールとして機能し、患者サンプル中のウイルスや細菌からのわずかな免疫原性反応さえも検知します。間接的なウェスタンブロットは、イメージングシステムによって検出された信号の強度を増幅する二次抗体の能力から、この感度にさらに基づいています。感度が高いということは、テストに必要な抗体が少なくて済むため、実験室のコストを大幅に削減できます。
利点：特異性
ウエスタンブロット法は、2つの大きな要因に特異性があります。最初に、ゲル電気泳動は、サンプルを異なるサイズ、電荷、および立体構造のタンパク質に分類します。ゲルで形成されたバンドは、目的のタンパク質またはポリペプチドのサイズに関する手がかりをすでに与えているため、このプロセス自体が検出に向けた大きなステップです。抗体-抗原相互作用の特異性は、2番目の大きな要因として機能します。特定の抗体は特定のタンパク質に親和性を示すため、このプロセスでは、300,000種類の異なるタンパク質の混合物であっても、標的タンパク質を選択的に検出できます。
欠点：誤った結果または主観的な結果になりやすい
その感度と特異性にもかかわらず、ウェスタンブロットは依然として誤った結果を生み出す可能性があります。抗体が意図しないタンパク質と反応すると、偽陽性になります。これは、HIVの検査を受けている患者が結核または多くの寄生虫感染症にかかっているときによく起こります。一方、偽陰性は、より大きなタンパク質が膜に適切に移行するのに十分な時間を与えられない場合、容易に生じる可能性があります。不適切なブロッティングと処理は、多くの場合、歪んだ、色あせた、または複数のバンドを生成し、テスト結果を技術者の解釈の対象にします。
短所：高いコストと技術的要求
ウェスタンブロットのコストは、タグ付き抗体、熟練したアナリスト、および実験装置の個々の大きな支出の複合です。繊細なプロセスであるウエスタンブロット法では、サンプルの成分を適切に識別するために、すべてのステップで精度が必要です。試薬濃度やインキュベーション期間の軽微な誤差は、プロセス全体にとって悲惨なものになる可能性があります。最後に、検出およびイメージングに必要な機器（化学発光、蛍光、放射性、またはレーザー検出システム）は、平均的な微生物学ユニットにとっては高価すぎる可能性があります。